Является препаратом с бактерицидным типом действия, проявляющий тропность к дезоксирибонуклеиновой кислоте. Механизм действия заключается в биохимическом восстановлении 5-нитрогруппы внутриклеточными транспортными белками анаэробных микроорганизмов и простейших. Является эффективным противомикробным и противопротозойным средством широкого спектра действия.
Препарат проявляет высокую активность в отношении: Trichomonas vaginalis, Entamoeba histolytica; а также в отношении грамотрицательных анаэробов Bacteroides spp. (в том числе В. fragilis, В. ovatus, В. distasonis, В. thetaiotaomicron, В. vulgatus), Fusobacterium spp. и некоторых грамположительных анаэробов (чувствительные штаммы Eubacterium spp, Clostridium spp, Peptostreptococcus spp, Peptococcus spp.). К метронидазолу нечувствительны аэробные микроорганизмы и факультативные анаэробы, но в присутствии смешанной флоры (аэробы и анаэробы), действует синергидно с антибиотиками, эффективными против обычных аэробов.